Allgemeines gemischtes Yule-Koaleszenten-Modell ⇐ Artikelentwürfe

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Das „allgemeine gemischte Yule-Koaleszenzmodell“ (GMYC), auch „generalisiertes gemischtes Yule-Koaleszenzmodell“ genannt, ist eine Methode in der molekularen Phylogenetik und Systematik, um aus DNA-Sequenzdaten mutmaßliche Artengrenzen abzuleiten. Es wird am häufigsten auf einen einzelnen genetischen Ort angewendet ... und erfordert einen ultrametrischen phylogenetischen Baum als Eingabe, in dem alle Spitzen den gleichen Abstand von der Wurzel haben, da die Zweiglängen auf die Zeit skaliert werden. Die Methode basiert auf der Annahme, dass tiefere Zweige in einem Genbaum die Diversifizierung zwischen den Arten widerspiegeln (ein Geburtsprozess (makroevolutionärer Prozess), während flachere Zweige in der Nähe der Spitzen die Koaleszenztheorie (Zusammenführung von Abstammungslinien (Evolution)) innerhalb der Arten (ein mikroevolutionärer Prozess der Populationsgenetik) widerspiegeln.

GMYC wurde 2006 eingeführt und wurde zu einem der ersten weit verbreiteten baumbasierten Ansätze zur molekularen Artenabgrenzung. Spätere Arbeiten verfeinerten den Wahrscheinlichkeitsrahmen, schlugen Varianten vor, die mehr als eine Schwellenwertverschiebung über den Baum hinweg ermöglichen, und erweiterten den Ansatz zur bayesschen phylogenetischen Schlussfolgerung (Phylogenie). Es wird häufig bei der DNA-Barkodierung, bei Biodiversitätsuntersuchungen und bei Studien wenig bekannter Gruppen verwendet, wurde aber auch wegen der Einschränkungen kritisiert, die der Einzelort-Inferenz innewohnen, und wegen der Empfindlichkeit gegenüber Stichprobenentwürfen (Sampling (Statistik)) und Baumrekonstruktionsmethoden.

==Hintergrund==
Artengrenzen in der Taxonomie (Taxonomie (Biologie)) und in der Systematik wurden traditionell auf der Grundlage der Morphologie (Morphologie (Biologie)) gezogen. Molekulare Daten fügten eine weitere Beweislinie hinzu, insbesondere in Gruppen mit wenigen diagnostischen morphologischen Merkmalen oder einer großen Anzahl unbeschriebener Formen. GMYC entstand während der Entwicklung DNA-basierter Artenabgrenzungsmethoden als eine Möglichkeit, Arthypothesen aus einem datierten Genbaum statt aus einem festen Sequenzabstands-Cut-off zu extrahieren.

Die beiden von GMYC kombinierten Ideen stammen aus unterschiedlichen Teilen der Evolutionstheorie. Der Geburtsprozess|Yule-Prozess ist ein einfaches Verzweigungsmodell, das zur Darstellung der Diversifizierung zwischen Arten verwendet wird. Der Prozess ist nach dem britischen Statistiker Udny Yule benannt, dessen Arbeit aus dem Jahr 1925 Verzweigungsmodelle in das Studium der Evolution einführte.





















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